تحریم طالبان
با امتناع طالبان از تحویل اسامه بن‌لادن، سازمان ملل تحت‌فشار آمریکا و رفتارهای غیرانسانی طالبان با مردم و حمله به دفاتر سازمان ملل، تحریم‌هایی را در ۱۴ نوامبر ۱۹۹۹، علیه طالبان وضع کرد. مسدودشدن دارایی‌های طالبان در خارج از افغانستان و ممنوع‌شدن پروازهای هوایی افغانستان از جمله این تحریم‌ها بود بااین‌حال طالبان از تحویل اسامه بن‌لادن خودداری ورزید.
با فشارهایی‌که علیه بن‌لادن یا ادامه حیات اسامه بن‌لادن و القاعده در افغانستان اعمال می‌شد در درون طالبان به تحویل بن‌لادن یا ادامه حمایت از او اختلاف پیدا شد. در میان‌گروه طالبان، نظر برخی از آنها از جمله وزارت خارجه طالبان به تداوم حمایت از بن‌لادن منفی بود و تهدیدات اسامه بن‌لادن و نیز معاون او، ایمن الظوهری (که اهل مصر بود و از زمان سادات با دولت مصر اختلاف داشت) علیه آمریکا و منافع آن را برای حکومت طالبان مضر و خطرناک ارزیابی می‌کردند؛ ولی ملا عمر و سایر رهبران بلندپایه طالبان به‌خصوص جناح تندرو آن با این دیدگاه مخالف بودند.